MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus plantarum JDM1

Total Repeats: 51936

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012984	GAA	3	9	241	249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254555170
2	NC_012984	GA	3	6	264	269	50 %	0 %	50 %	0 %	254555170
3	NC_012984	ACA	2	6	306	311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254555170
4	NC_012984	CAA	2	6	314	319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254555170
5	NC_012984	GAAAC	2	10	346	355	60 %	0 %	20 %	20 %	254555170
6	NC_012984	GAA	2	6	436	441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254555170
7	NC_012984	GTT	2	6	462	467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254555170
8	NC_012984	GAAT	2	8	582	589	50 %	25 %	25 %	0 %	254555170
9	NC_012984	TAAT	2	8	590	597	50 %	50 %	0 %	0 %	254555170
10	NC_012984	A	6	6	610	615	100 %	0 %	0 %	0 %	254555170
11	NC_012984	AGG	2	6	617	622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	254555170
12	NC_012984	GAA	2	6	631	636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254555170
13	NC_012984	TTA	2	6	655	660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254555170
14	NC_012984	CGA	2	6	663	668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555170
15	NC_012984	T	6	6	676	681	0 %	100 %	0 %	0 %	254555170
16	NC_012984	AAG	2	6	701	706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254555170
17	NC_012984	TTC	2	6	709	714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254555170
18	NC_012984	GAT	2	6	739	744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555170
19	NC_012984	CGAA	2	8	776	783	50 %	0 %	25 %	25 %	254555170
20	NC_012984	AAT	2	6	1009	1014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254555170
21	NC_012984	ACC	2	6	1024	1029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254555170
22	NC_012984	GAAA	2	8	1151	1158	75 %	0 %	25 %	0 %	254555170
23	NC_012984	ACTG	2	8	1212	1219	25 %	25 %	25 %	25 %	254555170
24	NC_012984	TGG	2	6	1251	1256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254555170
25	NC_012984	TCA	2	6	1574	1579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555171
26	NC_012984	AAT	2	6	1588	1593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254555171
27	NC_012984	TTC	2	6	1608	1613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254555171
28	NC_012984	ACC	2	6	1708	1713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254555171
29	NC_012984	TGA	2	6	1725	1730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555171
30	NC_012984	CAA	2	6	1731	1736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254555171
31	NC_012984	A	7	7	1800	1806	100 %	0 %	0 %	0 %	254555171
32	NC_012984	AGA	2	6	1812	1817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254555171
33	NC_012984	AAT	2	6	2125	2130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254555171
34	NC_012984	ATG	2	6	2138	2143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555171
35	NC_012984	GAT	2	6	2181	2186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555171
36	NC_012984	AAT	2	6	2194	2199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254555171
37	NC_012984	CAG	2	6	2357	2362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555171
38	NC_012984	AAT	2	6	2401	2406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254555171
39	NC_012984	ACGATT	2	12	2440	2451	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	254555171
40	NC_012984	AAC	2	6	2486	2491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254555171
41	NC_012984	AAG	2	6	2552	2557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254555171
42	NC_012984	CGTT	2	8	2563	2570	0 %	50 %	25 %	25 %	254555171
43	NC_012984	GAA	2	6	2635	2640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254555171
44	NC_012984	AT	3	6	3239	3244	50 %	50 %	0 %	0 %	254555172
45	NC_012984	CAT	2	6	3275	3280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555172
46	NC_012984	GGT	2	6	3288	3293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254555172
47	NC_012984	AAC	2	6	3317	3322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254555172
48	NC_012984	GTTA	2	8	3326	3333	25 %	50 %	25 %	0 %	254555172
49	NC_012984	GAT	2	6	3345	3350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555172
50	NC_012984	CGG	2	6	3351	3356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254555172
51	NC_012984	TTGAAG	2	12	3385	3396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555172
52	NC_012984	T	6	6	3408	3413	0 %	100 %	0 %	0 %	254555172
53	NC_012984	CACCG	2	10	3597	3606	20 %	0 %	20 %	60 %	254555173
54	NC_012984	AATT	2	8	3619	3626	50 %	50 %	0 %	0 %	254555173
55	NC_012984	ACC	2	6	3636	3641	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254555173
56	NC_012984	GCG	2	6	3707	3712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254555173
57	NC_012984	AGCG	2	8	3718	3725	25 %	0 %	50 %	25 %	254555173
58	NC_012984	ATC	2	6	3733	3738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555173
59	NC_012984	TATGGA	2	12	3845	3856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555173
60	NC_012984	AAC	2	6	3916	3921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254555173
61	NC_012984	GCA	2	6	3950	3955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555173
62	NC_012984	ATC	2	6	4017	4022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555173
63	NC_012984	GCA	2	6	4043	4048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555173
64	NC_012984	GTCG	2	8	4148	4155	0 %	25 %	50 %	25 %	254555173
65	NC_012984	CAA	3	9	4191	4199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254555173
66	NC_012984	TTA	2	6	4227	4232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254555173
67	NC_012984	GAT	2	6	4245	4250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555173
68	NC_012984	CAA	2	6	4302	4307	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254555173
69	NC_012984	TGA	2	6	4348	4353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555173
70	NC_012984	TTA	3	9	4380	4388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254555173
71	NC_012984	CTG	2	6	4431	4436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254555173
72	NC_012984	ATTA	2	8	4502	4509	50 %	50 %	0 %	0 %	254555173
73	NC_012984	GAG	2	6	4551	4556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	254555173
74	NC_012984	CGAAAA	2	12	4570	4581	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	254555174
75	NC_012984	ATG	2	6	4611	4616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555174
76	NC_012984	ACG	2	6	4682	4687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555174
77	NC_012984	CCA	2	6	4702	4707	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254555174
78	NC_012984	TTG	2	6	4722	4727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254555174
79	NC_012984	TGA	2	6	4738	4743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555174
80	NC_012984	ATA	2	6	4791	4796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254555174
81	NC_012984	A	6	6	4845	4850	100 %	0 %	0 %	0 %	254555174
82	NC_012984	GGT	2	6	4895	4900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254555174
83	NC_012984	GGT	2	6	4907	4912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254555174
84	NC_012984	TGG	2	6	4930	4935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254555174
85	NC_012984	GTT	2	6	4958	4963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254555174
86	NC_012984	ATC	2	6	4972	4977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555174
87	NC_012984	TTA	2	6	5014	5019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254555174
88	NC_012984	TGA	2	6	5077	5082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555174
89	NC_012984	CGG	2	6	5094	5099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254555174
90	NC_012984	ACC	2	6	5138	5143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254555174
91	NC_012984	GAC	2	6	5161	5166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555174
92	NC_012984	TGA	2	6	5230	5235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555174
93	NC_012984	ATAAGA	2	12	5295	5306	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	254555174
94	NC_012984	GTTGC	2	10	5366	5375	0 %	40 %	40 %	20 %	254555174
95	NC_012984	GAC	2	6	5384	5389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555174
96	NC_012984	TGA	2	6	5403	5408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555174
97	NC_012984	CAA	2	6	5416	5421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254555174
98	NC_012984	TACG	2	8	5428	5435	25 %	25 %	25 %	25 %	254555174
99	NC_012984	GAA	2	6	5450	5455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254555174
100	NC_012984	TCA	2	6	5481	5486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555174
101	NC_012984	TTG	2	6	5510	5515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254555174
102	NC_012984	TGT	2	6	5569	5574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254555174
103	NC_012984	GCA	2	6	5645	5650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555174
104	NC_012984	GCT	2	6	5756	5761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254555174
105	NC_012984	A	6	6	5785	5790	100 %	0 %	0 %	0 %	254555174
106	NC_012984	TAG	2	6	5836	5841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555174
107	NC_012984	GTT	2	6	5863	5868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254555174
108	NC_012984	GAA	2	6	5999	6004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254555174
109	NC_012984	GGT	2	6	6041	6046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254555174
110	NC_012984	ATTA	2	8	6079	6086	50 %	50 %	0 %	0 %	254555174
111	NC_012984	GTT	2	6	6139	6144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254555174
112	NC_012984	ACC	2	6	6196	6201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254555174
113	NC_012984	GAA	2	6	6251	6256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254555174
114	NC_012984	TGAG	2	8	6258	6265	25 %	25 %	50 %	0 %	254555174
115	NC_012984	GTT	2	6	6299	6304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254555174
116	NC_012984	GCG	2	6	6373	6378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254555174
117	NC_012984	TGA	2	6	6394	6399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555174
118	NC_012984	TCT	2	6	6423	6428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254555174
119	NC_012984	GT	3	6	6511	6516	0 %	50 %	50 %	0 %	254555174
120	NC_012984	ACGT	2	8	6791	6798	25 %	25 %	25 %	25 %	254555175
121	NC_012984	CGG	2	6	6820	6825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254555175
122	NC_012984	AAG	2	6	6874	6879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254555175
123	NC_012984	TTG	2	6	6890	6895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254555175
124	NC_012984	ATC	2	6	6914	6919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555175
125	NC_012984	ATG	2	6	7130	7135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555175
126	NC_012984	CAG	2	6	7151	7156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555175
127	NC_012984	ACA	2	6	7219	7224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254555175
128	NC_012984	TTG	2	6	7270	7275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254555175
129	NC_012984	ATT	2	6	7402	7407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254555175
130	NC_012984	AT	3	6	7476	7481	50 %	50 %	0 %	0 %	254555175
131	NC_012984	ATG	2	6	7559	7564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555175
132	NC_012984	CGG	2	6	7603	7608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254555175
133	NC_012984	GAA	2	6	7791	7796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254555175
134	NC_012984	TGA	2	6	7851	7856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555175
135	NC_012984	ATT	2	6	7867	7872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254555175
136	NC_012984	GAA	2	6	7899	7904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254555175
137	NC_012984	TAGC	2	8	8054	8061	25 %	25 %	25 %	25 %	254555175
138	NC_012984	ATT	2	6	8080	8085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254555175
139	NC_012984	GAA	2	6	8089	8094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254555175
140	NC_012984	TGAAGA	2	12	8166	8177	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	254555175
141	NC_012984	GAA	4	12	8185	8196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254555175
142	NC_012984	GTG	2	6	8267	8272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254555175
143	NC_012984	ATG	3	9	8300	8308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555175
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149	NC_012984	ATC	2	6	8671	8676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555175
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153	NC_012984	TCA	3	9	8822	8830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555175
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155	NC_012984	GTG	2	6	8885	8890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254555175
156	NC_012984	GAA	2	6	8922	8927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254555175
157	NC_012984	GAC	2	6	8946	8951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555175
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159	NC_012984	GAT	2	6	9073	9078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555175
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163	NC_012984	CGA	2	6	9909	9914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555176
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167	NC_012984	TGC	2	6	10077	10082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254555176
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241	NC_012984	CAAT	2	8	13405	13412	50 %	25 %	0 %	25 %	254555180
242	NC_012984	AGC	2	6	13439	13444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555180
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245	NC_012984	GTT	2	6	13547	13552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254555180
246	NC_012984	CAAA	2	8	13568	13575	75 %	0 %	0 %	25 %	254555180
247	NC_012984	AAC	2	6	13749	13754	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254555181
248	NC_012984	CAC	2	6	13774	13779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254555181
249	NC_012984	GC	3	6	13880	13885	0 %	0 %	50 %	50 %	254555181
250	NC_012984	TTA	2	6	13962	13967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254555181
251	NC_012984	GAT	2	6	13986	13991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555181
252	NC_012984	TGG	2	6	13994	13999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254555181
253	NC_012984	CTA	2	6	14054	14059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254555181
254	NC_012984	GCG	2	6	14090	14095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254555181
255	NC_012984	ATG	2	6	14143	14148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555181
256	NC_012984	TTA	2	6	14160	14165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254555181
257	NC_012984	GAA	2	6	14256	14261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254555181
258	NC_012984	ATG	3	9	14281	14289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555181
259	NC_012984	CCG	2	6	14335	14340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254555181
260	NC_012984	ATT	2	6	14361	14366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254555181
261	NC_012984	TG	3	6	14500	14505	0 %	50 %	50 %	0 %	254555181
262	NC_012984	GTA	2	6	14512	14517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555181
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264	NC_012984	GAA	2	6	14553	14558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254555181
265	NC_012984	TGG	2	6	14572	14577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254555181
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268	NC_012984	GTA	2	6	14728	14733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555181
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275	NC_012984	GGT	2	6	14994	14999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254555181
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282	NC_012984	TGA	2	6	15579	15584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254555182
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382	NC_012984	TGG	2	6	22479	22484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254555186
383	NC_012984	TTCAC	2	10	22487	22496	20 %	40 %	0 %	40 %	254555186
384	NC_012984	TTG	2	6	22498	22503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254555186
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386	NC_012984	ATGA	2	8	22891	22898	50 %	25 %	25 %	0 %	254555187
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498	NC_012984	CGG	2	6	29072	29077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254555191
499	NC_012984	TG	3	6	29081	29086	0 %	50 %	50 %	0 %	254555191
500	NC_012984	ACG	2	6	29158	29163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254555191

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